两者本质上没有区别,二者区别仅限于安装方式不同。包是 R 函数、实例数据、预编译代码的集合,包括 R 程序,注释文档、实例、测试数据等。Bioconductor就是一个基于R语言的、面向基因组信息分析的应用软件集合。Bioconductor的应用功能是以包的集成形式呈现在用户面前。
包是 R 函数、实例数据、预编译代码的集合,包括 R 程序,注释文档、实例、测试数据等。R 语言相关的包一般存储安装目录下对 “library” 目录,默认情况在 R 语言安装完成已经自带来一些常用对包,当然我们也可以在后期自定义添加一些要使用的包。
计算机上存储包的目录称为库,函数.libPaths()显示库所在的位置,library()不加任何参数可以显示库中的所有的包。
R语言实际也是由多个R软件包构成,包括:base datasets utils grDevices graphics stats methods splines stats4 tcltk他们提供了种类繁多的默认函数和数据集
Bioconductor就是一个基于R语言的、面向基因组信息分析的应用软件集合。Bioconductor的应用功能是以包的集成形式呈现在用户面前,它提供的软件包中包括各种基因组数据分析和注释工具,其中大多数工具是针对DNA微阵列或基因芯片数据的处理、分析、注释及可视化的。同时,Bioconductor还提供许多与DNA微阵列相关的数据包。
延伸阅读:
什么是R语言?
R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优异工具。
R是一套由数据操作、计算和图形展示功能整合而成的套件。包括:有效的数据存储和处理功能,一套完整的数组(特别是矩阵)计算操作符,拥有完整体系的数据分析工具,为数据分析和显示提供的强大图形功能,一套(源自S语言)完善、简单、有效的编程语言(包括条件、循环、自定义函数、输入输出功能)。
在这里使用“环境”(environment)是为了说明R的定位是一个完善、统一的系统,而非其他数据分析软件那样作为一个专门、不灵活的附属工具。
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