剑桥结构晶体数据库是什么

剑桥结构晶体数据库是什么

剑桥结构晶体数据库(Cambridge Structural Database,CSD)是一个专门收录有机和金属有机化合物的晶体结构信息的数据库,由剑桥晶体学数据中心(CCDC)负责维护和更新。CSD包括以下主要内容:化合物的晶体数据、原子坐标、热振动参数、空间群、晶胞参数、实验条件和方法、文献引用等。其中,化合物的晶体数据是CSD中最为核心的信息,包括化合物的化学名、分子式、分子结构、晶胞参数、空间群、Z值(每个晶胞中分子的数量)、晶体的密度、折射率等。这些信息都是通过X射线晶体学或中子衍射实验获得的,因此具有很高的科学价值和研究价值。CSD不仅是研究晶体结构的重要工具,也是进行化学信息学研究的重要数据库

一、CSD的结构与组成

CSD由两部分组成:主数据库和衍生数据库。主数据库包括所有的晶体结构数据,而衍生数据库则是在主数据库的基础上,通过一系列的数据处理和分析,生成的具有特定研究目标或应用目的的数据库。主数据库的数据来源主要是科学文献和直接提交的研究数据。衍生数据库则可能包括:具有特定结构特征的化合物数据库、具有特定物理化学性质的化合物数据库、具有特定反应性或生物活性的化合物数据库等。

二、CSD的获取与使用

CSD数据库的获取主要依赖于用户的订阅。CCDC每年都会发布新的CSD版本,用户可以通过订阅服务来获取最新的数据库。用户也可以通过CCDC的在线服务,直接在网上查询和下载晶体结构数据。CSD的使用主要通过CCDC提供的一系列软件工具,如ConQuest、Mercury、GOLD等。这些工具不仅可以用来查询和浏览晶体结构数据,还可以用来进行数据分析和建模。

三、CSD在科研中的应用

CSD的应用范围非常广泛,包括化学、物理、材料科学、地球科学、生物科学等多个领域。在化学领域,CSD被广泛用于研究晶体结构、分子结构、化学键、分子间作用、晶体对称性、晶体生长等问题。在物理领域,CSD被用于研究晶体的物理性质,如电子结构、光学性质、热学性质等。在材料科学领域,CSD被用于研究新型材料的设计和性能预测。在地球科学领域,CSD被用于研究矿物的结构和性质。在生物科学领域,CSD被用于研究生物大分子的结构和功能。

四、CSD的发展与未来

随着科学技术的发展和数据量的增长,CSD也在不断更新和扩展。CCDC正在努力提升CSD的数据质量,扩大数据覆盖范围,提高数据的可访问性和可用性。未来,CSD将更加侧重于数据的深度挖掘和知识发现,以满足科研工作的新需求。同时,CSD也将更加注重数据的开放性和共享性,以推动科学的进步和社会的发展。

相关问答FAQs:

什么是剑桥结构晶体数据库?

剑桥结构晶体数据库(Cambridge Structural Database,简称CSD)是世界上最全面、最全面的有机和金属-有机晶体结构数据库之一。它收集了全球范围内的晶体结构数据,为研究人员提供了丰富的有机和金属-有机晶体结构信息。CSD中包含了数百万个有机和金属-有机晶体结构的详细信息,这些信息可以通过各种搜索和分析工具进行访问和利用。

CSD的数据来源是什么?

CSD的数据来源非常广泛,包括科学文献、学术研究、晶体学家的实验数据等。剑桥晶体学数据中心(CCDC)负责收集、整理和验证这些数据,确保其准确性和可靠性。此外,CCDC还与全球范围内的晶体学家和研究机构建立了广泛的合作关系,以获取更多的晶体结构数据。

CSD的应用领域有哪些?

CSD的应用领域非常广泛,涵盖了许多不同的科学和工程领域。以下是一些常见的应用领域:

  1. 药物研发:CSD中包含了大量的有机晶体结构信息,可以帮助药物研发人员了解药物分子的结构和性质,优化药物的设计和合成过程。

  2. 材料科学:CSD中的金属-有机晶体结构信息对于材料科学研究非常重要。这些结构可以帮助科学家了解材料的晶体结构、性能和应用潜力,从而设计和合成新材料。

  3. 催化剂设计:CSD中的晶体结构信息对于催化剂设计非常有价值。科学家可以通过分析晶体结构中的催化剂活性中心,优化催化剂的性能和效率。

  4. 分子模拟和计算化学:CSD中的晶体结构信息可以用于分子模拟和计算化学研究。科学家可以利用这些结构进行分子动力学模拟、能量计算和反应路径预测等。

总之,剑桥结构晶体数据库是一个宝贵的资源,为研究人员提供了丰富的有机和金属-有机晶体结构信息。它在许多领域的应用中发挥着重要的作用,并为科学研究和工程发展提供了支持。

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