Python如何用NumPy读取和保存点云数据

前言

最近在学习点云处理的时候用到了Modelnet40数据集，该数据集总共有40个类别，每个样本的点云数据存放在一个TXT文件中，每行的前3个数据代表一个点的xyz坐标。我需要把TXT文件中的每个点读取出来，然后用Open3D进行显示。怎么把数据从TXT文件中读取出来呢？NumPy提供了一个功能非常强大的函数loadtxt可以非常简单地实现这个功能。来看一下代码：

import open3d as o3dimport numpy as npdef main():    points_data = np.loadtxt("airplane_0001.txt", delimiter=",", dtype=np.float32)    pcd = o3d.geometry.PointCloud()    pcd.points = o3d.utility.Vector3dVector(points_data[:, :3])    o3d.visualization.draw_geometries([pcd])if __name__ == '__main__':    main()

从上面的代码可以看到，只需要一行代码就可以把TXT文件中的点云数据读取进来了，接下来就可以调用Open3D的接口进行显示了。在介绍loadtxt函数的用法之前，

顺便看一下Open3D的显示效果：

loadtxt函数的用法

基本用法

在上面的例子中，由于TXT里面每一行的数据是用逗号分割的，所以在调用loadtxt函数的时候除了设置文件路径外，还需要设置参数delimiter=","。另外，该函数默认的数据类型为float64，如果是其他数据类型的话还需要设置dtype为对应类型。

points_data = np.loadtxt("airplane_0001.txt", delimiter=",") #没有指定数据类型print('shape: ', points_data.shape)print('data type: ', points_data.dtype)

结果：

shape: (10000, 6)
data type: float64

指定每一列的数据类型

假如我们有一个CSV文件：

x,y,z,label,id-0.098790,-0.182300,0.163800,1,10.994600,0.074420,0.010250,0.2,20.189900,-0.292200,-0.926300,3,3-0.989200,0.074610,-0.012350,4,4

该文件前面3列的数据类型是浮点型，后面2列的数据类型为整型，那么按照前面的方式设置dtype来读取就不合适了。不过没关系，loadtxt函数可以设置每一列数据的数据类型，只不过稍微复杂一点，来看一下代码：

data = np.loadtxt("test.txt", delimiter=",",                      dtype={'names': ('x', 'y', 'z', 'label', 'id'),                             'formats': ('f4', 'f4', 'f4', 'i4', 'i4')},                      skiprows=1)print('data: ', data)print('data type: ', data.dtype)

这段代码的重点是dtype={}里面的内容，'names'用来设置每一列数据的名称，'formats'则用来设置每一列数据的数据类型，其中'f4'表示float32，'i4'表示int32。另外，CSV文件中的名列前茅行不是数据内容，可以设置参数skiprows=1跳过名列前茅行的内容。

输出结果：

data: [(-0.09879, -0.1823 , 0.1638 , 1, 1) ( 0.9946 , 0.07442, 0.01025, 0, 2)
( 0.1899 , -0.2922 , -0.9263 , 3, 3) (-0.9892 , 0.07461, -0.01235, 4, 4)]
data type: [(‘x’, ‘<f4’), (‘y’, ‘<f4’), (‘z’, ‘<f4’), (‘label’, ‘<i4’), (‘id’, ‘<i4’)]

可以看到，通过这样的方式设置dtype，读取的每一行数据变成了一个tuple类型。

结合生成器使用

从NumPy的文档中可以知道，loadtxt函数的名列前茅个参数可以是文件对象、文件名或者生成器。传入生成器有什么用呢？我们来看几个例子。

处理多个分隔符

假如我们的文件内容是这样的，每一行数据有3个分隔符”,”，”/”和”-“：

9.87,1.82,1.63,1/11-19.94,7.44,1.02,1/11-21.89,2.92,9.26,1/11-30.98,7.46,1.23,1/11-4

这种情况下不能通过delimiter参数设置多个分隔符，这时候就可以通过生成器来进行处理：

def generate_lines(file_path, delimiters=[]):    with open("test.txt") as f:        for line in f:            line = line.strip()            for d in delimiters:                line = line.replace(d, " ")            yield linedelimiters = [",", "/", "-"]generator = generate_lines("test.txt", delimiters)data = np.loadtxt(generator)print(data)

这段代码构建了一个生成器将文件中每一行的分隔符全部替换成loadtxt函数默认的空格分隔符，然后把生成器传入loadtxt函数，这样loadtxt函数就能成功解析文件中的数据了。

输出结果：

[[ 9.87 1.82 1.63 1. 11. 1. ]
[ 9.94 7.44 1.02 1. 11. 2. ]
[ 1.89 2.92 9.26 1. 11. 3. ]
[ 0.98 7.46 1.23 1. 11. 4. ]]

读取指定的行

在某些情况下，我们需要读取指定几行的数据，那么也可以通过生成器来实现。还是上面的文件内容，我们通过生成器来读取第2行和第3行：

def generate_lines(file_path, delimiters=[], rows=[]):    with open("test.txt") as f:        for i, line in enumerate(f):            line = line.strip()            for d in delimiters:                line = line.replace(d, " ")            if i in rows:                yield linedelimiters = [",", "/", "-"]rows = [1, 2]generator = generate_lines("test.txt", delimiters, rows)data = np.loadtxt(generator)print(data)

输出结果：

[[ 9.94 7.44 1.02 1. 11. 2. ]
[ 1.89 2.92 9.26 1. 11. 3. ]]

通过上面的例子可以知道，loadtxt函数结合生成器使用可以实现很多的功能。

tofile和fromfile函数

从TXT文件中读取到点云数据后，我想把数据保存到二进制文件中，需要怎么操作呢？NumPy的ndarray类提供了tofile函数可以非常方便地将数据保存到二进制文件中。把数据以二进制文件保存后又怎么读进来呢？NumPy还提供了一个fromfile函数用于从文本文件和二进制文件中读取数据。

import open3d as o3dimport numpy as npdef main():    points_data = np.loadtxt(        "airplane_0001.txt", delimiter=",", dtype=np.float32)    bin_file = 'airplane_0001.bin'    points_data = points_data[:, :3]    points_data.tofile(bin_file)    pc = np.fromfile(bin_file, dtype=np.float32)    pc = pc.reshape(-1, 3)    pcd = o3d.geometry.PointCloud()    pcd.points = o3d.utility.Vector3dVector(pc)    o3d.visualization.draw_geometries([pcd])if __name__ == '__main__':    main()

在上面这段示例代码中，我从airplane_0001.txt文件中读取了点云数据，然后通过tofile函数将数据保存到二进制文件airplane_0001.bin中，再用fromfile函数从二进制文件中把点云数据读取出来用Open3D进行显示。

为了前后呼应，让我们换个角度再看一眼显示效果：