什么数据库可以查化合物对应靶点
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有许多数据库可以查询化合物对应的靶点。以下是五个常用的数据库:
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ChEMBL:ChEMBL是一个广泛使用的药物化学和生物学数据库,它包含了大量的化合物和靶点的信息。ChEMBL中的数据主要来自于文献报道的生物活性实验结果,包括药物的活性和选择性数据。通过在ChEMBL中搜索化合物,可以找到与其相关的靶点信息。
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PubChem:PubChem是一个由美国国家医学图书馆(National Library of Medicine)开发和维护的化学物质数据库。它包含了大量化合物的结构信息、物理化学性质以及与之相关的生物活性数据。通过在PubChem中搜索化合物,可以找到与其相关的靶点信息。
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BindingDB:BindingDB是一个专门用于存储和检索化合物与蛋白质结合数据的数据库。它包含了大量的化合物-蛋白质结合实验数据,涵盖了多种生物活性测定方法和不同类型的化合物。通过在BindingDB中搜索化合物,可以找到与其结合的蛋白质靶点信息。
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DrugBank:DrugBank是一个综合性的药物信息数据库,提供了关于药物的详细信息,包括化学结构、药理学特性、药物靶点等。通过在DrugBank中搜索化合物,可以找到与其相关的靶点信息。
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Therapeutic Target Database(TTD):TTD是一个专门用于存储和检索药物靶点信息的数据库。它提供了包括化合物、蛋白质靶点、药物-靶点相互作用等方面的详细信息。通过在TTD中搜索化合物,可以找到与其相关的靶点信息。
以上这些数据库都提供了丰富的化合物和靶点的信息,可以帮助科研人员和药物研发人员进行药物靶点的研究和筛选工作。
3个月前 -
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在化学和生物领域中,了解化合物与靶点之间的关系对于药物研发和生物学研究非常重要。有许多数据库可以提供化合物与靶点的相关信息。下面介绍几个常用的数据库:
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PubChem:PubChem是由美国国立卫生研究院(NIH)建立的一个化学物质数据库,其中包含了大量的化合物信息。PubChem可以通过化合物的名称、结构或者其他标识符来搜索,并提供了与化合物相关的靶点、药物活性等信息。
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ChEMBL:ChEMBL是一个面向药物研发的数据库,它收集了大量的化合物与靶点的相关信息。ChEMBL中的数据来自于文献、专利和公共数据库等多个来源,可以提供化合物与靶点的结合亲和力、抑制常数等信息。
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DrugBank:DrugBank是一个包含药物及其相关信息的数据库。它提供了化合物与靶点的亲和力数据、药物作用机制等信息,同时还包括了药物的药代动力学、药物相互作用等方面的内容。
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BindingDB:BindingDB是一个专门收集化合物与蛋白质结合相关数据的数据库。它提供了大量的化合物-蛋白质相互作用数据,包括结合常数、结合位点信息等。
除了以上提到的数据库,还有许多其他的数据库也提供了化合物与靶点的相关信息,如ChemSpider、ZINC、PDB等。这些数据库可以帮助研究人员更好地理解化合物与靶点之间的相互作用,为药物研发和生物学研究提供重要的参考。
3个月前 -
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要查找化合物对应的靶点,可以使用一些专门的数据库和工具。以下是一些常用的数据库和操作流程。
- PubChem
PubChem是一个免费的公共化合物数据库,它提供了化合物的结构、化学性质、生物活性等信息。要查找化合物对应的靶点,可以按照以下步骤进行操作:
- 打开PubChem网站(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/);
- 在搜索框中输入化合物的名称或化学式;
- 点击搜索按钮,PubChem会显示与该化合物相关的信息,包括结构、性质、活性等;
- 在页面的左侧导航栏中,点击"Bioactivity"选项,可以查看该化合物的生物活性信息,包括与之相关的靶点和活性数据。
- ChEMBL
ChEMBL是一个面向药物研究的数据库,它提供了大量的化合物-靶点互作数据。要查找化合物对应的靶点,可以按照以下步骤进行操作:
- 打开ChEMBL网站(https://www.ebi.ac.uk/chembl/);
- 在搜索框中输入化合物的名称或化学式;
- 点击搜索按钮,ChEMBL会显示与该化合物相关的信息,包括结构、性质、活性等;
- 在页面的左侧导航栏中,点击"Targets"选项,可以查看该化合物的靶点信息,包括与之相关的活性数据和文献引用。
- DrugBank
DrugBank是一个药物信息数据库,它提供了大量的药物和药物靶点的信息。要查找化合物对应的靶点,可以按照以下步骤进行操作:
- 打开DrugBank网站(https://www.drugbank.ca/);
- 在搜索框中输入化合物的名称或化学式;
- 点击搜索按钮,DrugBank会显示与该化合物相关的信息,包括结构、性质、药理学等;
- 在页面的左侧导航栏中,点击"Targets"选项,可以查看该化合物的靶点信息,包括与之相关的药理学数据和文献引用。
- ChemSpider
ChemSpider是一个提供化学信息的在线化学数据库,它包含了大量的化合物和相关的数据。要查找化合物对应的靶点,可以按照以下步骤进行操作:
- 打开ChemSpider网站(http://www.chemspider.com/);
- 在搜索框中输入化合物的名称或化学式;
- 点击搜索按钮,ChemSpider会显示与该化合物相关的信息,包括结构、性质、化学反应等;
- 在页面的右侧面板中,可以查看该化合物的靶点信息,包括与之相关的活性数据和文献引用。
需要注意的是,以上数据库和工具都是根据已有的实验数据和文献报道提供化合物-靶点的信息,所以结果可能受到数据的限制和不确定性。此外,不同数据库和工具可能会提供不同的结果和信息,因此可以综合使用多个工具来获得更全面的信息。
3个月前 - PubChem