查代谢物功能的数据库是什么
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代谢物功能数据库是一种用于存储和管理代谢物功能信息的数据库。它收集和整理了大量的代谢物数据,并提供了丰富的功能注释和相关信息,帮助研究人员理解和解释代谢物的生物学功能。
以下是几个常用的代谢物功能数据库:
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Human Metabolome Database(HMDB):HMDB是一个广泛收集和整理人类代谢物数据的数据库。它提供了详细的代谢物注释,包括代谢途径、生物学功能、药理学作用等。HMDB还提供了结构搜索和代谢途径分析工具,帮助研究人员分析和理解代谢物的功能。
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Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG):KEGG是一个综合性的代谢物功能数据库,涵盖了多个生物物种的代谢途径和相关基因信息。它提供了代谢途径图和代谢物注释,帮助研究人员了解代谢物在生物体内的功能和相互关系。
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MetaboLights:MetaboLights是一个专门收集和整理代谢组学数据的数据库。它包含了大量的代谢物注释和功能信息,帮助研究人员分析和解释代谢组学实验结果。
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LipidMaps:LipidMaps是一个专注于脂质代谢物的数据库,提供了详细的脂质结构和功能注释。它包含了大量的脂质代谢途径和相关基因信息,帮助研究人员研究脂质代谢的生物学功能。
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BioCyc:BioCyc是一个综合性的代谢物功能数据库,涵盖了多个生物物种的代谢途径和相关基因信息。它提供了丰富的代谢物注释和功能信息,帮助研究人员理解和分析代谢物的生物学功能。
这些代谢物功能数据库为研究人员提供了丰富的代谢物注释和功能信息,帮助他们深入理解和解释代谢物在生物体内的作用和相互关系。同时,这些数据库还提供了丰富的工具和资源,帮助研究人员进行代谢组学数据分析和功能研究。
3个月前 -
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查代谢物功能的数据库主要有以下几种:
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Human Metabolome Database (HMDB):人类代谢物数据库是一个综合性的数据库,提供了人类生物体内代谢物的详细信息,包括化学结构、生理功能、代谢途径等。HMDB还提供了代谢物的质谱数据和核磁共振数据,方便科研人员进行代谢组学研究。
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Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG):KEGG是一个包含了大量生物学信息的数据库,其中包括代谢物的功能和代谢途径。KEGG提供了代谢物的KEGG ID、化学结构、生物学功能、代谢途径等详细信息,同时还提供了代谢物的相关基因和酶的信息,方便进行代谢物与基因的关联分析。
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Metabolomics Workbench:Metabolomics Workbench是一个专门用于代谢组学研究的数据库,其中包括了大量的代谢物数据和相关的生物学信息。Metabolomics Workbench提供了代谢物的质谱数据、核磁共振数据、代谢途径等信息,方便科研人员进行代谢组学分析和代谢物功能的研究。
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LipidMaps:LipidMaps是一个专门研究脂质代谢的数据库,其中包括了大量的脂质代谢物的结构信息、生物学功能、代谢途径等。LipidMaps提供了脂质代谢物的化学结构、质谱数据、生物学功能等详细信息,方便科研人员进行脂质代谢研究。
除了以上几个数据库外,还有一些其他的代谢物功能数据库,如ChEBI、PubChem、BioCyc等,这些数据库也提供了代谢物的详细信息和相关的生物学功能。科研人员可以根据自己的研究需要选择合适的数据库进行代谢物功能的查找和分析。
3个月前 -
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查代谢物功能的数据库主要有MetaboAnalyst、HMDB、KEGG、PubChem等。
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MetaboAnalyst(代谢物分析师)
MetaboAnalyst是一个免费的在线平台,旨在支持代谢组学数据分析和解释。它提供了丰富的代谢物功能和通路分析工具。用户可以通过上传代谢组学数据,进行代谢物功能注释和通路分析,从而了解代谢物在生物学过程中的功能和相互关系。 -
HMDB(人类代谢物数据库)
HMDB是一个详细描述人类生物体内代谢产物的数据库。它提供了超过4万个代谢物的信息,包括化学结构、生理学活性、代谢途径等。用户可以通过搜索代谢物名称或化学结构,了解代谢物的功能和相关信息。 -
KEGG(京都基因与基因组百科全书)
KEGG是一个综合性数据库,提供了基因、蛋白质、化合物和通路等多种生物信息资源。在KEGG数据库中,用户可以通过搜索代谢物名称或KEGG ID,了解代谢物的功能、代谢通路和相互作用等信息。 -
PubChem(公共化学数据库)
PubChem是美国国家生物技术信息中心(NCBI)提供的一个公共化学数据库。它收集了大量的化合物信息,包括代谢物。用户可以通过搜索代谢物名称或化学结构,了解代谢物的功能、生物活性和相关文献等信息。
以上这些数据库都提供了丰富的代谢物功能信息,用户可以根据自己的需求选择合适的数据库进行查询和分析。
3个月前 -