包含蛋白质的数据库是什么

worktile 其他 2

回复

共3条回复 我来回复
  • 不及物动词的头像
    不及物动词
    这个人很懒,什么都没有留下~
    评论

    包含蛋白质的数据库是生物科学和生物信息学领域中非常重要的资源。这些数据库收集、存储和分析蛋白质的信息,为研究人员和科学家提供了许多有关蛋白质结构、功能和相互作用的数据。以下是几个著名的蛋白质数据库:

    1. UniProt:UniProt是最全面的蛋白质数据库之一,它整合了多个蛋白质数据库的信息,包括Swiss-Prot、TrEMBL和PIR。UniProt提供了蛋白质序列、结构、功能、相互作用等方面的详细信息。

    2. Protein Data Bank(PDB):PDB是全球最大的蛋白质三维结构数据库。它存储了大量蛋白质的结晶结构和核磁共振结构解析数据,研究人员可以从中获取蛋白质结构的详细信息。

    3. NCBI Protein:NCBI Protein是美国国家生物技术信息中心(NCBI)提供的蛋白质数据库。它包含了来自各种来源的蛋白质序列和注释信息,包括基因组和转录组数据。

    4. Ensembl:Ensembl是一个综合性的基因组注释数据库,其中包括了大量的蛋白质信息。它提供了蛋白质序列、结构、功能、表达等方面的数据,以及与其他基因组数据的整合。

    5. STRING:STRING是一个蛋白质相互作用数据库,它整合了多个数据源的蛋白质相互作用信息,包括实验验证的和预测的相互作用。STRING可以帮助研究人员分析蛋白质网络和功能模块。

    这些蛋白质数据库为研究人员提供了丰富的蛋白质信息,有助于深入了解蛋白质的结构和功能,推动生物科学和药物研发的进展。

    1年前 0条评论
  • worktile的头像
    worktile
    Worktile官方账号
    评论

    包含蛋白质信息的数据库有很多,其中一些主要的数据库如下:

    1. UniProt:UniProt是一个综合性的蛋白质数据库,包含了来自不同物种的蛋白质序列、结构、功能和互作信息。它整合了多个子数据库,如UniProtKB(蛋白质序列和注释信息)、UniParc(蛋白质归档数据库)和UniRef(蛋白质聚类数据库)等。

    2. Protein Data Bank(PDB):PDB是一个蛋白质结构数据库,收集了全球范围内已知的蛋白质三维结构数据。它提供了蛋白质结构的原子级别坐标信息,包括晶体学和核磁共振等不同实验方法得到的结构数据。

    3. NCBI Protein:NCBI Protein是美国国家生物技术信息中心(NCBI)提供的一个蛋白质数据库,包含了来自不同物种的蛋白质序列、注释和分类信息。它整合了多个子数据库,如RefSeq(参考序列数据库)、GenBank(基因组序列数据库)和PDB等。

    4. Ensembl:Ensembl是一个整合了多个物种基因组数据的数据库,其中包含了蛋白质序列、结构和注释信息。它提供了基因组浏览器和分析工具,方便用户进行基因和蛋白质的研究。

    5. STRING:STRING是一个蛋白质互作网络数据库,整合了多个物种的蛋白质互作信息。它通过整合实验和计算预测的互作数据,提供了蛋白质之间的相互作用网络,帮助用户研究蛋白质功能和调控机制。

    除了以上提到的数据库,还有一些专门用于特定研究领域的蛋白质数据库,比如:KEGG(生物通路数据库)、Swiss-Prot(高质量注释蛋白质数据库)和InterPro(蛋白质家族和域数据库)等。这些数据库不仅提供了蛋白质序列和注释信息,还包含了丰富的功能和互作数据,为蛋白质研究提供了重要的资源和工具。

    1年前 0条评论
  • 飞飞的头像
    飞飞
    Worktile&PingCode市场小伙伴
    评论

    包含蛋白质的数据库是指收集、存储和管理蛋白质序列、结构和功能等相关信息的数据库。这些数据库提供了广泛的蛋白质数据,包括已知的蛋白质序列、结构、亚细胞定位、功能注释、相互作用、代谢途径等信息。以下是几个常用的包含蛋白质的数据库:

    1. UniProt:UniProt是一个全面、综合的蛋白质数据库,提供了大量的蛋白质信息,包括序列、结构、功能、相互作用等。UniProt数据库由三个不同的子数据库组成:UniProtKB(包括Swiss-Prot和TrEMBL)、UniRef和UniParc。

    2. Protein Data Bank(PDB):PDB是存储蛋白质结构信息的数据库,其中包含了大量的蛋白质三维结构数据。PDB数据库提供了各种不同方法得到的蛋白质结构数据,包括X射线晶体学、核磁共振、电子显微镜等。

    3. NCBI Protein:NCBI Protein是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护的一个蛋白质数据库。该数据库提供了全球各地的蛋白质序列和相关信息,包括序列、结构、功能、进化关系等。

    4. ExPASy:ExPASy是由瑞士生物信息学研究所维护的一个蛋白质分析工具和数据库门户网站。ExPASy提供了多个蛋白质数据库,包括Swiss-Prot、ProSite、ProDom、Protein Model Portal等。

    5. Pfam:Pfam是一个蛋白质家族数据库,提供了多个已知的蛋白质家族和域的信息。Pfam数据库通过对蛋白质序列的比对和模式识别来预测蛋白质的结构和功能。

    6. STRING:STRING是一个蛋白质相互作用网络数据库,提供了蛋白质间相互作用的信息。STRING数据库整合了来自多个来源的实验数据和计算预测数据,可以用于预测蛋白质复合物、信号通路和代谢途径。

    以上是一些常用的包含蛋白质的数据库,研究人员可以根据自己的需求选择适合的数据库来获取蛋白质相关的信息。

    1年前 0条评论
注册PingCode 在线客服
站长微信
站长微信
电话联系

400-800-1024

工作日9:30-21:00在线

分享本页
返回顶部