查询代谢物的数据库叫什么
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代谢物的数据库通常被称为代谢组学数据库。代谢组学数据库是一个专门收集和存储有关生物体内代谢产物的信息的数据库。这些数据库通常包含各种物种的代谢物数据,包括代谢产物的结构、性质、代谢途径、生物活性等信息。以下是几个常用的代谢组学数据库:
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Human Metabolome Database (HMDB):这是一个专门收集人类代谢产物信息的数据库,包含了超过114,000个代谢物的数据。HMDB提供了代谢物的结构、性质、生物活性以及相关的代谢通路信息。
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MetaboLights:这是一个综合性的代谢组学数据库,收集了来自各种物种的代谢物数据。MetaboLights中包含了代谢物的结构、性质、生物活性、代谢通路等信息,并提供了丰富的数据分析工具和资源。
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Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG):KEGG是一个综合性的生物信息学数据库,包含了大量的代谢物数据。在KEGG中,可以查询代谢物的结构、性质、代谢通路以及与其他生物分子的相互作用等信息。
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Metabolomics Workbench:这是一个由美国国家代谢组学中心(National Metabolomics Data Repository)维护的代谢组学数据库。在Metabolomics Workbench中,可以查询代谢物的结构、性质、生物活性等信息,并提供了丰富的数据分析工具和资源。
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LipidMaps:这是一个专门收集和存储脂质代谢物信息的数据库。LipidMaps中包含了大量的脂质代谢物的结构、性质、生物活性以及相关的代谢通路信息。
这些代谢组学数据库为研究人员提供了一个方便和全面的资源,可以帮助他们了解代谢物的特性和功能,以及代谢通路的调控机制。
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代谢物的数据库通常称为代谢物数据库(Metabolite Database),以下是几个常用的代谢物数据库:
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Human Metabolome Database(HMDB):人类代谢物数据库是一个综合性的代谢物数据库,包含了人类体内代谢产物的详细信息,如化学结构、生理活性、代谢途径等。该数据库还提供了代谢物的质谱图谱、核磁共振图谱等实验数据。
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KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes):KEGG是一个综合性的生物信息学数据库,包括代谢物数据库。在KEGG的代谢物数据库中,可以查询到各种生物体中的代谢产物及其相关的代谢途径、酶的参与等信息。
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PubChem:PubChem是美国国家生物技术信息中心(NCBI)开发的一个免费的化学物质数据库,其中包含了大量的代谢产物信息。在PubChem中,可以查询到代谢物的化学结构、物理化学性质、毒性信息等。
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MetaboLights:MetaboLights是一个专注于代谢组学研究的数据库,包含了大量的代谢物信息。该数据库提供了代谢物的质谱数据、核磁共振数据等实验数据,并且与其他生物信息学数据库进行了整合,方便用户进行数据分析和挖掘。
以上是一些常用的代谢物数据库,通过这些数据库可以获取到丰富的代谢物信息,帮助研究人员深入了解代谢物的性质和功能。
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代谢物数据库是用于存储和管理代谢物信息的数据库,主要用于研究代谢物在生物体内的产生、转化和消除过程。目前有多个代谢物数据库可供选择,其中一些较为常见和常用的代谢物数据库包括:HMDB(Human Metabolome Database)、MetaboLights、ChEBI(Chemical Entities of Biological Interest)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)等。
下面将对其中的代谢物数据库进行详细介绍:
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HMDB(Human Metabolome Database):HMDB是一个综合性的代谢物数据库,主要用于存储人类代谢物的信息。它包含了多种类型的代谢物数据,如化学结构、生物活性、代谢途径、生理功能等。同时,HMDB还提供了数据下载和查询工具,方便用户进行数据分析和挖掘。
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MetaboLights:MetaboLights是一个专注于代谢组学研究的数据库,主要用于存储代谢物谱图和代谢物注释信息。它提供了丰富的代谢物谱图数据,包括NMR谱图、质谱图等,并提供了一系列的分析工具和查询接口,方便用户进行代谢物数据的分析和挖掘。
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ChEBI(Chemical Entities of Biological Interest):ChEBI是一个综合性的化学实体数据库,主要用于存储和管理生物相关的化学实体信息,包括代谢物、药物、酶等。它提供了丰富的化学实体数据,如化学结构、生物活性、代谢途径等,并提供了一系列的查询工具和分析接口,方便用户进行数据的查询和分析。
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KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes):KEGG是一个综合性的基因组学数据库,主要用于存储和管理生物体的基因、代谢物和代谢通路等信息。它提供了丰富的基因和代谢物数据,包括基因组序列、基因功能、代谢途径等,并提供了一系列的分析工具和可视化接口,方便用户进行基因和代谢物数据的分析和挖掘。
以上是一些常见和常用的代谢物数据库,用户可以根据自己的需求选择合适的数据库进行查询和分析。同时,随着科学技术的不断发展,还会有更多新的代谢物数据库被开发出来,为代谢组学研究提供更多的数据资源和工具支持。
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