常用的基因数据库包括什么

常用的基因数据库包括以下几个：

1. 基因组数据库：基因组数据库包含各种生物的基因组序列信息。其中最著名的是国际基因组浏览器数据库（IGV）和基因组数据库（Genome Database，GDB）。IGV是一个在线的基因组浏览器，提供了各种生物的基因组序列、注释信息以及相关研究数据。GDB则是一个整合了多种生物的基因组信息的数据库，提供了详细的基因组注释和相关的研究数据。

2. 基因表达数据库：基因表达数据库主要用于存储和查询基因在不同组织、细胞和发育阶段中的表达情况。其中最著名的是基因表达数据库（Gene Expression Omnibus，GEO）和生物信息学资源中心（Bioinformatics Resource Centers，BRCs）。GEO是一个公共数据库，存储了大量的基因表达数据，并提供了丰富的分析工具和数据集。BRCs则是一系列的数据库，每个数据库都专注于一个具体的研究领域，如人类基因组、酵母基因组等。

3. 蛋白质数据库：蛋白质数据库存储了各种生物的蛋白质序列、结构和功能信息。其中最著名的是蛋白质数据库（Protein Data Bank，PDB）和蛋白质家族数据库（Protein Family Database，Pfam）。PDB是一个全球性的蛋白质结构数据库，存储了大量已知蛋白质的结构信息。Pfam则是一个基于蛋白质序列相似性的分类数据库，提供了蛋白质家族的注释和分类信息。

4. SNP数据库：SNP数据库存储了单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism，SNP）的信息。其中最著名的是人类基因组数据库（Human Genome Variation Database，HGVD）和国际人类基因组计划数据库（International HapMap Project，HapMap）。HGVD是一个日本人群的SNP数据库，提供了大量的SNP信息和相关研究数据。HapMap则是一个全球性的SNP数据库，包含了多个人群的SNP信息，用于研究人类基因组的变异和相关疾病。

5. miRNA数据库：miRNA数据库存储了microRNA（miRNA）的信息。其中最著名的是miRBase和TargetScan。miRBase是一个全球性的miRNA数据库，提供了各种物种的miRNA序列和注释信息。TargetScan则是一个miRNA靶标预测数据库，用于预测miRNA与靶基因的相互作用关系。

这些基因数据库提供了丰富的基因组、基因表达、蛋白质、SNP和miRNA等信息，为基因研究和生物信息学分析提供了重要的资源和工具。

常用的基因数据库主要包括以下几个：

1. 基因序列数据库：主要存储各种生物的基因序列信息，如基因组、转录组、蛋白质序列等。常用的基因序列数据库有GenBank、EMBL、DDBJ等。

2. 基因表达数据库：存储各种生物在不同组织、细胞类型、发育阶段等条件下的基因表达谱数据。常用的基因表达数据库有GEO、ArrayExpress、SRA等。

3. 蛋白质数据库：存储各种生物的蛋白质序列、结构、功能等信息。常用的蛋白质数据库有UniProt、Swiss-Prot、PDB等。

4. 基因功能注释数据库：存储各种生物基因的功能注释信息，如基因本体、通路、亚细胞定位等。常用的基因功能注释数据库有Gene Ontology、KEGG、Reactome等。

5. 基因变异数据库：存储各种生物的基因变异信息，如单核苷酸多态性（SNP）、结构变异等。常用的基因变异数据库有dbSNP、ClinVar、HGMD等。

6. 基因关联数据库：存储各种生物基因之间的关联关系，如蛋白质相互作用、基因共表达等。常用的基因关联数据库有STRING、BioGRID、CoExpress等。

7. 基因组数据库：存储各种生物基因组的序列、结构、功能等信息。常用的基因组数据库有Ensembl、UCSC Genome Browser、NCBI Genome等。

除了上述常用的基因数据库外，还有一些特定物种或特定领域的基因数据库，如人类基因组数据库HGNC、植物基因组数据库TAIR、微生物基因组数据库IMG等。这些数据库提供了丰富的基因信息资源，为基因功能研究、生物信息学分析等提供了重要的支持。

常用的基因数据库包括以下几种：

1. 基因组数据库：基因组数据库存储了各种生物的完整基因组序列信息。常见的基因组数据库包括GenBank、Ensembl、NCBI等。

2. 转录组数据库：转录组数据库存储了各种生物在不同组织、发育阶段或环境条件下的转录组数据，包括mRNA的表达水平、剪接变异等。常见的转录组数据库包括NCBI Gene Expression Omnibus (GEO)、ArrayExpress等。

3. 蛋白质数据库：蛋白质数据库存储了各种生物的蛋白质序列、结构和功能信息。常见的蛋白质数据库包括UniProt、Protein Data Bank (PDB)等。

4. 互作数据库：互作数据库存储了蛋白质之间的相互作用信息，有助于理解蛋白质的功能和信号传导网络。常见的互作数据库包括STRING、BioGRID等。

5. 疾病数据库：疾病数据库存储了各种疾病与基因、突变、表型等之间的关联信息，有助于研究疾病的发病机制和诊断治疗。常见的疾病数据库包括OMIM、ClinVar等。

6. 基因表达数据库：基因表达数据库存储了各种生物在不同组织、发育阶段或疾病状态下的基因表达水平信息，有助于理解基因在生物过程中的功能和调控。常见的基因表达数据库包括GTEx、Human Protein Atlas等。

7. 遗传变异数据库：遗传变异数据库存储了各种生物的遗传变异信息，包括单核苷酸多态性(SNP)、拷贝数变异(CNV)等，有助于研究遗传疾病和个体间的差异。常见的遗传变异数据库包括dbSNP、1000 Genomes Project等。

8. 基因调控数据库：基因调控数据库存储了各种生物基因调控元件、转录因子结合位点等信息，有助于理解基因调控网络和表观遗传调控。常见的基因调控数据库包括ENCODE、Epigenomics Roadmap等。

以上是常见的基因数据库，研究者可以根据自己的研究需要选择合适的数据库进行数据查询和分析。