酶的数据库登录号是什么
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酶的数据库登录号是指在酶数据库中为每个酶分配的唯一标识符。不同的酶数据库可能采用不同的登录号系统,下面是一些常用的酶数据库及其登录号系统:
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Enzyme Commission (EC)号:EC号是国际酶学委员会(International Union of Biochemistry and Molecular Biology,IUBMB)为每个已知酶分配的唯一标识符。EC号由四个数字组成,分别表示酶的分类号、亚类号、亚亚类号和酶的顺序号。例如,EC 1.1.1.1代表酒精脱氢酶。
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UniProt登录号:UniProt是一个综合性的蛋白质数据库,其中包括了大量的酶信息。在UniProt中,每个蛋白质都有一个唯一的登录号,通常以字母和数字的组合表示,如P00761。
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Protein Data Bank (PDB)登录号:PDB是一个存储蛋白质三维结构的数据库,其中也包括了许多酶的结构信息。在PDB中,每个蛋白质都有一个唯一的登录号,通常由四个字母组成,如1HSG。
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KEGG酶数据库登录号:KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是一个综合性的基因组学数据库,其中包括了许多酶的信息。在KEGG酶数据库中,每个酶都有一个唯一的登录号,通常以字母和数字的组合表示,如EC:1.1.1.1。
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BRENDA酶数据库登录号:BRENDA(BRaunschweig ENzyme DAtabase)是一个综合性的酶数据库,其中包括了大量的酶的功能、代谢通路等信息。在BRENDA中,每个酶都有一个唯一的登录号,通常以字母和数字的组合表示,如EC 1.1.1.1。
这些酶数据库登录号的存在使得科研人员能够方便地查询和引用特定酶的相关信息,加快了酶研究的进展。
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酶的数据库登录号是EC号(Enzyme Commission number)。
EC号是一种用于标识和分类酶的系统,由国际酶学委员会(International Union of Biochemistry and Molecular Biology, IUBMB)制定和维护。每个酶都被赋予一个唯一的EC号,用于描述该酶的催化活性。
EC号由四个数字组成,以点分隔。这四个数字分别代表了酶的不同层级信息。具体解释如下:
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第一个数字表示酶所属的主要催化类别(enzyme class):
- 1:氧化还原酶(oxidoreductases)
- 2:转移酶(transferases)
- 3:水解酶(hydrolases)
- 4:合成酶/合成酶(lyases)
- 5:异构酶/异构酶(isomerases)
- 6:连接酶/连接酶(ligases)
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第二个数字表示酶所属的亚类别(sub-class)。
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第三个数字表示酶的子类别(sub-subclass)。
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第四个数字表示具体的酶。
举个例子,EC号为1.1.1.1的酶是乙醛脱氢酶,EC号为2.7.1.1的酶是磷酸转移酶。
EC号可以通过查询酶数据库(如UniProt、BRENDA、KEGG等)来获取酶的详细信息,包括酶的命名、催化反应、底物特异性等。酶的EC号是研究酶学和酶工程的重要工具,有助于研究者理解酶的功能和催化机制。
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酶的数据库登录号是指酶在相关数据库中的唯一标识号码。不同的酶数据库可能采用不同的登录号格式,下面将以常用的酶数据库为例进行介绍。
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Enzyme Commission (EC)号码:
Enzyme Commission号码是酶分类的国际标准,用于描述酶的功能和催化反应。EC号码由四个数字组成,分别表示酶类别、亚类别、亚亚类别和具体酶的序号。例如,EC 1.1.1.1表示第1类酶中的第1个酶。在Enzyme数据库中,酶的登录号就是对应的EC号码。 -
UniProt号码:
UniProt(Universal Protein Resource)是一个综合性的蛋白质数据库,其中包含大量的酶信息。在UniProt数据库中,酶的登录号是由字母和数字组成的一串字符,用于唯一标识酶的序列和功能。例如,P00750是人类纤维蛋白酶的UniProt号码。 -
PDB号码:
PDB(Protein Data Bank)是一个存储蛋白质三维结构的数据库。在PDB数据库中,酶的登录号是由四个字符组成的一串字符,用于唯一标识酶的结构。例如,1ATP是腺苷三磷酸酶的PDB号码。 -
KEGG号码:
KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是一个综合性的代谢通路数据库。在KEGG数据库中,酶的登录号是由字母和数字组成的一串字符,用于唯一标识酶的代谢路径和功能。例如,EC: 1.1.1.1是醛脱氢酶的KEGG号码。
总之,不同的酶数据库使用不同的登录号格式,用于唯一标识酶的功能、序列、结构或代谢路径。研究人员可以根据需要在相应的数据库中查询和获取酶的详细信息。
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